Colica reni? infezione vie urinarie?

Buongiorno,
sto ormai "combattendo" da 2 mesi con dei fastidi/dolori al rene sx.
A metà maggio mi sono recato in pronto soccorso con forti dolori al fianco sx. Hanno riscontrato la presenza di sangue nelle urine, leucociti WBC a 14,3 (valori rif 4-9) e s-glucosio a 124 (v.r. 74-110). Mi è stato prescritto Ciproxin per 5 giorni, la riesecuzione degli esami del sangue ed un analisi ecografica.
L'esito dell'ecografia effettuata a metà giugno è stato:
"Fegato nei limiti volumetrici ed ecostrutturali esente da lesioni focali con discreto incremento dell'ecogenicità di fondo da steatosi. Alcune aree ipoecogene di rismarmio in sede pericolecistica. Non dilatazione delle vie biliari intra ed estraepatiche. Colecisti regolare. Reni in sede regolari per dimensioni e spessore parenchimale. Non evidenti formazioni calcolotiche nel loro contesto. Non dilatazione delle cavità escretrici calico-pieliche. Milza e pancreas nei limiti. In piccolo bacino vescica distesa esente da inclusi endoluminali. Non versamento o linfoadenomegalie in sede endoaddominale."
L'esame del sangue successivo invece ha riscontrato tutto nella norma ma con una leggera alterazione degli Eritrociti RBC (5,78), una presenza di Eritrociti nelle urine (150), urinocoltura negativa e PAR test negativo.
La mattina del giorno successivo all'esame del sangue infatti ho espulso urine di colore marroncino (prima e unica volta).
Il mio medico di base mi ha ri-prescritto gli esami del sangue con questo esito:
Glicemia 114, Bilirubina Indiretta 1,6 (v.r. 0,1-0,8), Bilirubina Diretta 0,66 (v.r. 0,1-0,3), Bilirubina Totale 2,26 (v.r. 0,1-1,1), Alt GPT 81 (v.r. 10-50), Colesterolo tot 136. Di sicuro il mio fegato era un po' sofferente: mi sono un po' regolato nell'alimentazione infatti...
Al consulto urologico (cambierò sicuramente specialista la prox volta!) mi è stato detto che è tutto nella norma (prostata compresa).
Il problema è che sono un paio di settimane che mi sento abbastanza stanco continuo ad avere alcuni fastidi al rene (sensazione di contrattura) e che ogni 2-3 giorni la mattina ho bruciori/prurito al pene e un forte fastidio (simile a colica) che svanisce nel giro di un oretta.
Sono una persona abbastanza ansiosa... Ho quindi timore di avere qlcosa di grave... Inoltre non capisco perchè continuo a non stare bene dopo quasi 2 mesi...
Potete essermi d'aiuto?
Grazie mille.