Sonno molto agitato in bambino quasi tre anni

Salve,
vorrei esporre la situazione del mio bimbo che compirà tre anni tra qualche mese.parto dall'inizio da quando era piccolissimo 40 giorni ha sofferto di RGE patologico,curato a più riprese con omeprazolo e risoltosi(credo)a 18 mesi.in tutto questo periodo e nei periodi di riacutizzazione dell'RGE era agitatissimo,in partocolare la notte,urlava e piangeva e aveva risvegli continui,di giorno i sintomi erano limitati a uno sporadico singhiozzo. dopo i 18 mesi però la situazione sonno non è migliorata di molto,i sintomi dell'RGE sembrano non esserci più,ma la notte ogni notte continua ad essere agitatissimo,striscia le gambe in continuazione,(come se fossero "senza riposo")a volte si lamenta,ha risvegli continui,si gira in maniera talmente violenta che si "buttai" da una parte all'altra del letto e a volte sbatte e si fa male,inutile dire che noi genitori siamo sfiniti anche perché né noi né lui dormiamo neanche un'ora. al mattino è spesso stanco e nervoso,frequenta il nido solo al mattino 3 ore per esigenze lavorative e ci va volentieri.
anche il riposo pomeridiano è sempre così agitato.più volte abbiamo esposto la situazione al pediatra,che alla fine ci ha fatto fare un prelievo sospettando eventuali intolleranza alimentari,che per fortuna non ci sono.è risultata un'anemia che il pediatra definisce lieve e che non necessita di trattamento.(sideremia a 47/mg/100 ml e ferritina 25,60 ng/ml,HGB 12g/dl)nelle feci è risultato presente l'helicobacter pylori,abbiamo poi fatto altre due volte l'esame in cui è risultato negativo. quindi siamo di nuovo al punto di partenza,non sappiamo cosa fare,tutte le notti sono una tortura per tutti e tre,vorrei solo sapere se rassegnarmi alla situazione,ma temo che il motivo di tale agitazione sia organico e non psicologico.il pediatra nel frattempo ci ha prescritto l'atarax per aiutare il bimbo a dormire meglio ma non ha nessun effetto e dopo una settimana non l'ho più dato.
vorrei solo un consiglio,anche se mi rendo conto che non sia facile senza vedere il bambino.è un bimbo sano,è sempre cresciuto bene,non ha altri problemi a parte l'ammalarsi di frequente.ma la notte "si trasforma",e davvero il suo sonno non è normale,e ormai sono quasi tre anni che è così. spero in un vostro consiglio.