Cistiti da vaginiti ?

Buongiorno Dottori.
ho eseguito tamponi vaginali e uretrali , cui risultavano essere positivi per forte carica all'enterobacter.
come sintomi ho fortissimi bruciori uretrali.
sono stata visitata da un urologo (settimana scorsa) il quale ha sostenuto che guai a trattare un enterobacter uretrale,che si trova normalmente...e cosi anche in vagina.
mi ha prescritto 3 integratori fra cui il mannosio perchè profondamente contrario a qualsiasi tipo di antiobiotico .
fatto sta che venerdi notte mi sveglio nella notte dal bruciore e ho avuto un attacco di cistite.
ho cercato di raccogliere un campione e portarlo in laboratorio (tra l'altro sabato mattina c'è un solo laboratorio privato aperto qua da me) , ma proprio non riuscivo a camminare .
tengo a precisare che non ho mai fatto una cosa del genere..ma ho preso l'antibiogramma del tampone uretrale ho visto che l'enterobacter era sensibile al bactrim e ho assunto questo antibiotico.
la sfortuna poi vuole che queste cose succedano sempre in giorni festivi...
questa stamattina ho prontamente chiamato la mia ginecologa , che mi ha detto di fare 7 gg di bactrim e applicare una crema vaginale antibiotica.
vi chiedo se la causa du queste mie uretriti-cistiti possono essere delle vaginiti.
e se mi dovessi trovare ancora una volta in una situazione del genere qual'è il comportamento clinico più giusto da avere...in mancanza di urincoltura che medicine poter prendere?
ha sbagliato l'urologo secondo voi?