Proteus e sospetto pielonefrite

Buongiorno.

Scrivo perché sono un po' preoccupata.

Sono affetta da sclerosi multipla RR (in cura con immunomodulante Aubagio), endometriosi (ipertiroidismo). . . circa 10 giorni fa ho accusato i sintomi di una cistite (per me ricorrenti) che ho tentato di curare con Monuril.
Sembrava andasse meglio... senonché dopo circa tre giorni sono ritornati impetuosi i sintomi.
Bruciori lancinanti alla minzione, con lieve sanguinamento finale, cattivo odore delle urine (pesce marcio). . . sino a quando circa 3 giorni fa è comparso un dolore al fianco destro, altezza rene.
Ho contattato il mio medico, il quale mi ha prescritto urinocoltura.
La mia neurologa mi ha consigliato urgente visita urologica con eco ai reni, invitandomi a non sottovalutare la comparsa di febbre.
Ieri mi sono sottoposta all'urinocoltura.
Ieri sera è comparso lieve rialzo febbrile (37. 5), per cui (spaventata) ho iniziato terapia antibiotica, su consiglio del medico di famiglia, (ciprofloxacina), senza avere ancora antibiogramma.
Oggi ho avuto esito dell'urinocoltura (ancora no antibiogramma) che ha rilevato presenza massiccia del Proteus e pus nelle urine.
Il dolore al rene è presente e comincio a preoccuparmi, considerato che mi hanno preallarmato sul rischio di pielonefrite.
Secondo voi, il dolore al rene è indice della presenza di questo tipo di infezione renale o è un sintomo tipico dell'infezione alle vie urinarie da Proteus?
È necessario un approfondimento della questione a livello dei reni o la cura antibiotica può mettermi al riparo da questo rischio?
Chiedo aiuto, perché sono particolarmente preoccupata, tenuto conto della già precaria condizione fisica.
Grazie a chiunque vorrà aiutarmi.